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一.獨(dú)立性先天不足
按照目前出版業(yè)的有關(guān)規(guī)定，每一種期刊出版單位必須有符合國(guó)務(wù)院出版行政主管部門認(rèn)定的主辦單位及其主管機(jī)關(guān)，若無主辦或主管單位，則需要掛靠在某個(gè)具備獨(dú)立法人資質(zhì)的單位名下，期刊出版單位直接與其相關(guān)的機(jī)關(guān)、部門、企事業(yè)單位掛鉤，或者成為其下屬二級(jí)單位。換言之，學(xué)術(shù)期刊隸屬于體制內(nèi)，期刊作為市場(chǎng)主體的自主能力難以發(fā)揮，這樣的管理模式必然會(huì)削弱其參與市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)的能力。同時(shí)，學(xué)術(shù)期刊主管或主辦單位的法人不應(yīng)作為該刊物的法人，新聞出版行政管理部門要求學(xué)術(shù)期刊必須擁有自己獨(dú)立的法人，在出版許可、經(jīng)營(yíng)許可、年度審核等方面完全以獨(dú)立法人身份來辦理，但在辦刊經(jīng)費(fèi)、行政管理、辦刊理念、運(yùn)作細(xì)節(jié)等方面又基本不獨(dú)立，必須服從于主管或者主辦單位。在這種情況下，學(xué)術(shù)期刊的獨(dú)立法人資質(zhì)有名無實(shí)，期刊在本質(zhì)上仍然是出版行政主管部門掌握、調(diào)控的一種資源，市場(chǎng)機(jī)制的作用得不到發(fā)揮。
二.靈活性先天不足
在風(fēng)格上，學(xué)術(shù)刊物具有相對(duì)的穩(wěn)定性，在裝幀設(shè)計(jì)、欄目設(shè)置、文章風(fēng)格等方面追求經(jīng)典化，刊物的風(fēng)格一旦形成，習(xí)慣于保持整體的延續(xù)性，很少出現(xiàn)較大的改變。在經(jīng)營(yíng)上，學(xué)術(shù)期刊雖然具有廣告經(jīng)營(yíng)的權(quán)力，但只有少部分刊物通過這種手段獲取收益，這種經(jīng)營(yíng)方式在眾多學(xué)術(shù)期刊中不占主導(dǎo)地位，而且這些收益并非全部直接注入辦刊經(jīng)費(fèi)中去。與學(xué)術(shù)期刊不同，各類報(bào)紙、通俗刊物的經(jīng)營(yíng)方式則靈活多變，可以通過刊登廣告、企業(yè)贊助等方式獲得經(jīng)濟(jì)效益。除了嚴(yán)格遵守基本的政治原則之外，這些報(bào)刊還可以根據(jù)社會(huì)輿論、公眾需求、市場(chǎng)導(dǎo)向等因素隨時(shí)進(jìn)行各種調(diào)整，具有很強(qiáng)的靈活性。這種靈活性賦予了報(bào)刊較大的經(jīng)營(yíng)自主權(quán)，辦報(bào)辦刊者在追求報(bào)刊品位的同時(shí)，可以充分考慮成本與收益的問題。例如，某些報(bào)刊甚至可以完全不計(jì)成本，完全依靠廣告收益和其他方面的收益維持運(yùn)轉(zhuǎn)。此類做法不僅可以彌補(bǔ)成本上的損失，而且能夠盈利，而對(duì)學(xué)術(shù)刊物來說則幾無可能。
三.通俗性先天不足
學(xué)術(shù)期刊是一個(gè)“非大眾化”的產(chǎn)品，主要面向高等院校和科研機(jī)構(gòu)的從業(yè)者，是科研工作者寫作、出版研究成果的重要渠道，普通讀者群不是它所定位的服務(wù)對(duì)象。長(zhǎng)期以來，學(xué)術(shù)期刊基本形成了一套獨(dú)特的話語體系，作者和刊物編輯均習(xí)慣用“學(xué)術(shù)性”的語言來表達(dá)自己的觀點(diǎn)，逐漸形成了一個(gè)獨(dú)具特色的“學(xué)術(shù)生產(chǎn)共同體”。在這個(gè)共同體內(nèi)，生產(chǎn)者已經(jīng)養(yǎng)成了所謂的“學(xué)術(shù)化”的職業(yè)習(xí)慣，甚至出現(xiàn)文章越是“曲高和寡”，越深?yuàn)W難懂，其價(jià)值就越大，公眾閱讀能力范圍內(nèi)的大白話反而成了學(xué)術(shù)水平不高的一種表現(xiàn)。中國(guó)的學(xué)術(shù)刊物不像Science雜志那樣要求用通俗語言去闡釋科學(xué)現(xiàn)象，更沒有提出論文的表述要照顧到不同讀者的需求。因此，通俗性先天不足導(dǎo)致學(xué)術(shù)期刊不能更直接地面向大眾，只能在有限的群體內(nèi)傳播，受眾數(shù)量自然難以擴(kuò)大，這是其全面市場(chǎng)化的一大障礙。
四.商品性先天不足
學(xué)術(shù)期刊的商品性先天不足主要表現(xiàn)在兩個(gè)方面：一是，大多數(shù)學(xué)術(shù)期刊生產(chǎn)出來之后，只有少量屬于作者和訂閱者，其余印刷品的去向主要是贈(zèng)閱和“回爐”，基本沒有進(jìn)入市場(chǎng)發(fā)行、流通。二是，學(xué)術(shù)期刊標(biāo)定的價(jià)格并不完全是根據(jù)商品的成本進(jìn)行利潤(rùn)核算之后制定出來的。雖然學(xué)術(shù)期刊的生產(chǎn)需要一定的成本，出版單位在印刷的時(shí)候也標(biāo)定了其作為商品的價(jià)格，但由于沒有足夠的發(fā)行量支撐，如果嚴(yán)格按照其標(biāo)定的價(jià)格發(fā)行銷售，不僅不能盈利，甚至連收回成本都存在困難。另外，本就先天不足的學(xué)術(shù)期刊，其商品性在出版之后被電子數(shù)據(jù)庫(kù)再次弱化。目前，很多紙質(zhì)學(xué)術(shù)期刊出版之后被制作成電子文獻(xiàn)，以電子數(shù)據(jù)庫(kù)為中介進(jìn)行交易，但這種交易不是發(fā)生在學(xué)術(shù)刊物和消費(fèi)者之間，而是發(fā)生在電子數(shù)據(jù)庫(kù)和消費(fèi)者之間。由于當(dāng)前學(xué)術(shù)評(píng)價(jià)體系依賴電子數(shù)據(jù)庫(kù)確認(rèn)發(fā)表信息的真實(shí)性，大多數(shù)學(xué)術(shù)期刊難以與之抗衡，反而要主動(dòng)要求進(jìn)入電子數(shù)據(jù)庫(kù)。在這一過程中，這些電子數(shù)據(jù)庫(kù)成為學(xué)術(shù)期刊電子產(chǎn)品交易的總，而學(xué)術(shù)期刊從中獲得的收益卻微乎其微，其商品性因此被大大弱化。
以目前的情況，學(xué)術(shù)期刊全面市場(chǎng)化是不現(xiàn)實(shí)的，雖然個(gè)別學(xué)術(shù)期刊中存在著收取版面費(fèi)、變相的廣告費(fèi)等現(xiàn)象，蘊(yùn)含著一定的市場(chǎng)化因子，但這些現(xiàn)象的存在主要與當(dāng)前的科研評(píng)價(jià)機(jī)制有關(guān)，不能說它具有市場(chǎng)化的巨大潛力。即使要推行學(xué)術(shù)期刊的市場(chǎng)化運(yùn)作，也必須分步驟、有選擇地推進(jìn)，既不能急于求成，更不能期望一步到位。同時(shí)，應(yīng)適當(dāng)保留一部分具有很高學(xué)術(shù)聲譽(yù)、不以營(yíng)利為目的的權(quán)威期刊，并予以財(cái)政支持，以保證學(xué)術(shù)研究的純潔度和獨(dú)立性。